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STAP細胞の懐疑点 PART705 (1001ﾚｽ)
STAP細胞の懐疑点 PART705 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/
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459: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 11:27:05.84 >>99 >塩酸に浸けて「酸性の溶液に」って雑すぎだろ >硫酸とか酢酸とかクエン酸とか色々試さなくちゃいかんのでは 実験に使った緩衝液HBSSには弱酸のリン酸や炭酸の塩が含まれてるし、 細胞自体にも弱酸の塩が含まれており、強酸である塩酸を微量加えれば 塩素イオンの一部が塩になり、その代わりに弱酸であるリン酸や炭酸等の 塩から弱酸であるリン酸や炭酸等が遊離しリン酸や炭酸部分の化学的活性が 上がる。また、微量の硫酸を加えても緩衝液HBSSのために硫酸イオンに 代わってリン酸や炭酸等が遊離するので微量の塩酸を加えたのと化学的活性 状態は同じである。よって、微量の塩酸を加える事だけで十分なのである。 ただし、クエン酸添加の場合はクエン酸回路の活性化が高まる可能性が 排除できないので、微量の塩酸を加える事だけでクエン酸添加の代替とは なりえない可能性はあるが、pHを下げるのに塩酸だと微量なのにクエン酸 だと比較的多く必要なので、最も化学的に影響の少ないpHを下げる方法 として微量の塩酸添加を選択したと考えられる。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/459
511: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 12:11:02.77 [Quality control method for RNA-seq using single nucleotide polymorphism allele frequency](Takaho A. Endo著・日本分子生物学会誌「Genes to Cells」) の本文がまだオープンアクセスになってないのでアブストラクトで気になった 部分があった。 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/gtc.12178/abstract >The analysis indicated that different types of cells and chromosomal >abnormalities might have been erroneously included in the dataset. 不確実な推量を表す助動詞「might」が使われており、日経サイエンスより トーンダウンと思われる。単に遠藤高帆の主観による我田引水の憶測や妄想を あの大隅典子氏が理事長を務める「日本分子生物学会」の英文学会誌に載せた だけではないのか？ 私にはNGS分析のための無償ソフトを使う能力もないし、有料ソフトを 購入するつもりもないので、上記の遠藤高帆の論文を検証される方には、 上述の疑問点、特に日経サイエンス号外からの主張の変更点の有無を 検証される事を期待する。 以上、私のようなNGS解析未経験者が指摘せずとも、上記の遠藤高帆の論文を 検証される方は、すぐに下記の問題点に気付かれるだろうが、遠藤高帆に気兼ね せずに追及していただきたいので、ここで指摘した。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/511
519: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 12:19:26.10 >>511の続き、 あの大隅典子氏が理事長を務める「日本分子生物学会」がNHKスペシャル [調査報告・ＳＴＡＰ細胞・不正の深層](7月27日放送)でも主導的役割を しており、遠藤高帆の不確実な推量を表す助動詞「might」論文を掲載 した事も合わせて考えると、単に正義感や成り行きの意地だけでなく、 何らかの裏事情があるのではないかとの疑念を感じる。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/519
522: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 12:23:39.33 >>518 初めから結論有りきの「我田引水」の憶測や妄想の論文を学会誌に 掲載したとすれば問題があるな。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/522
530: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 12:30:16.83 不確実な推量を表す助動詞「might」論文掲載について日本分子生物学会理事は 記者会見すべきだ。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/530
555: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:03:07.64 >>511の続き、 [Quality control method for RNA-seq using single nucleotide polymorphism allele frequency](Takaho A. Endo著・日本分子生物学会誌「Genes to Cells」) のアブストラクトの表記についての違和感。 http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/gtc.12178/abstract >Here, I show how SNPs in mRNAs can be used to evaluate RNA-seq >experiments by focusing on RNA-seq data based on a recently >retracted paper on stimulus-triggered acquisition of pluripotency >(STAP) cells. 「SNPs in mRNAs」だが人間の場合は遺伝子がDNAなのでSNPはDNAに存在する。 DNAのSNPにはmRNAに転写されない部分や、mRNAに一時的に転写されてもすぐに 消滅する劣勢遺伝子由来のmRNAの鋳型になる部分や、pre-mRNAに転写されても mRNAになる前に除去されて消滅するイントロン部分の鋳型になる部分が存在 する。それゆえ、「SNPs in mRNAs」とは不正確な用法である。「分子生物学」 学会誌なのに「分子生物学」の根幹ともいうべき術語の不正確な用法を黙認 するのだろうか？ 上記の指摘を遠藤高帆の上記の論文に対する批判として述べると細かい用語の 誤用の揚げ足取りになるが、学会誌に掲載した日本分子生物学会の責任追及 としては揚げ足取りにはならないので述べた。 尚、トリソミー指摘の件で遠藤高帆はマウスのstrainでも誤用があった。 しかも単なる誤用でなくマウスの父母の同定ができてなかった。そういう 分析レベルでトリソミー主張できるのか疑念を感じる。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/555
563: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:10:32.54 >>518 >まあ、学術的な意義は皆無だからしょうがないかな。 表向きにはSTAP細胞とは無関係にNGSのmRNAデータの分析例としては、断定 できるなら学術的意義がある。しかし、アブストラクトに不確実な推量を表す 助動詞「might」が使われており、遠藤高帆による初めから結論有りきの 「我田引水」の憶測や妄想が書かれてるだけなら学術的価値は全く無い。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/563
567: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:14:54.09 >>563の補足 >>563を言い換えると、もし仮にNGSのmRNAデータの分析で断定できる 結論が示されたならNGSのmRNAデータの分析例として学術的に価値がある。 しかし、実際には「我田引水」の憶測や妄想が書かれてるだけの疑いが あるという事だ。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/567
579: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:29:01.89 >>568 中世の魔女狩りの対象とされた女性に精神的に問題がある女性もいた可能性は 否定できないが、仮に精神的に問題があっても「魔女」呼ばわりや拷問や 火あぶりは正当化できない。 小保方の場合も、研究不正常習者でSTAP事件では偽計業務妨害罪を犯した主犯 だが、若山の犯行部分まで責任を負わせるのは行き過ぎである。全ての罪を 小保方に負わせて「トカゲのシッポ切り」で幕引きを図るのは良くない。 尚、原発推進に協力した御用学者や隠れ御用学者には、小保方より悪質な者も 多くいたと私は考える。小保方は研究職にいた最悪の人物ではない。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/579
585: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:31:51.52 >>579の補足 ただし、検証実験でSTAP細胞作成できず、かつ、誤認しそうな現象も 確認できず、逆転写qPCRで各種の多能性マーカーの発現も確認できねば 理研は小保方を告訴すべきだし、実刑が相当だと思う。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/585
591: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:34:55.26 >>573 >>578 検証実験でSTAP細胞作成できず、かつ、誤認しそうな現象も確認できず、 逆転写qPCRで各種の多能性マーカーの発現も確認できねば、丹羽も 諭旨免職が妥当。確認できれば戒告処分が妥当。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/591
597: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:39:24.15 >>555の訂正 (誤)上記の論文に対する批判として述べると細かい用語の誤用の揚げ足取り (正)上記の論文に対する批判として述べると用語の誤用の揚げ足取り http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/597
599: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:41:40.32 早稲田大学には調査報告書のウソの指摘のメールを出さねばならんな。 理研も早稲田大学も委員になる弁護士って悪徳弁護士だらけだな。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/599
603: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:48:02.55 不確実な推量を表す助動詞「might」論文掲載について日本分子生物学会理事は 記者会見すべきだ。 (>>511参照) ついでに「SNP」の誤用の黙認についても釈明すべきだ。(>>555参照) http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/603
609: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 13:54:12.11 >>602 疑惑発生後に疑惑を打ち消す意味で発表した実現不能なプロトコルの 単独責任著者という事の意味は大きい。11jigen氏による博士論文画像 不正流用の指摘が一週間遅れれば、世界中の悪徳研究者による再現追試 成功との虚偽報告が相次いで収拾がつかなくなっていた危険があった。 比較的簡単に単独で追試できるのに単独追試せず、あたかも丹羽が 単独追試したかのごとく誤解を与えるプロトコルの発表責任は大きい。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/609
617: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 14:03:55.56 >>605 >浅見はバカで妄想で凝り固まっているから小保方がSTAP細胞を捏造して >若山が捏造してなかった場合のことを考えられない ES混入に関するだけでも、若山に下記の疑惑がある。 (PART704スレ・48-52参照) http://wc2014.2ch.net/test/read.cgi/life/1411299589/48n-52 また、キメラ・マウス不正もある。letter論文Fig.1ab http://www.nature.com/nature/journal/v505/n7485/fig_tab/nature12969_F1.html の不自然な臍の緒写真を撮影したのが若山である事から、キメラ・マウス 不正作成も明らか。(4倍体法では臍の緒はマウス胎児と同程度に蛍光するはず なのに蛍光が弱すぎる。) 尚、若山は写真撮影で胎盤をピンセットでいじった事は認めているので 胎盤の蛍光を言い出したのも若山の可能性大。(少なくとも過去スレでまこと しやかに笹井が言い出したとする説はデマ。) http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/617
621: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 14:06:59.07 さらに、6月16日記者会見で虚偽の「知り合いによる個人的解析結果」を 「第三者機関による解析結果」と偽った事も看過できない。 [若山照彦教授の2014年6月16日記者会見における虚偽発表] http://www.eonet.ne.jp/~masanori-asami/Riken/press-conference_doubt_Wakayama.htm http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/621
623: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 14:13:32.27 なぜ、日本分子生物学会が若山の不正を意図的に見逃すのかについて 疑念を感じる。 小保方のNGS試料へのES混入を決定づける遠藤高帆のトリソミー論文の アブストラクトには最重要部分に不確実な推量を表す助動詞「might」 があり(>>511参照) 、しかも分子生物学の重要な術語である「SNP」の 誤用もある(>>555参照) のに学会誌に掲載した事についても合わせて 釈明すべきだ。単なる正義感による暴走とは思えない。何らかの裏事情 がある疑念を感じる。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/623
625: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 14:18:27.08 >>624 >浅見は英語も分からなければ、SNPの意味も分かっていない。 人間のSNPはDNAにある。 それも知らない低能。 実名で言ってみろ、低能。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/625
644: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I [] 2014/09/23(火) 14:44:20.53 >>632 >浅見のバッカ、SNP RNA でググれカス 「SNP RNA」のGoogle検索でトップにヒットした英語版wikipediaの 「Single-nucleotide polymorphism」には、 http://en.wikipedia.org/wiki/Single-nucleotide_polymorphism > Single Nucleotide Polymorphism (SNP, pronounced snip; plural snips) >is a DNA sequence variation occurring commonly within a population >(e.g. 1%) in which a single nucleotide ― A, T, C or G ― in the genome >(or other shared sequence) differs between members of a biological >species or paired chromosomes. DNA sequence variation(DNA配列の変異)と書かれてるだろ。アホ。 SNPにはmRNAやpre-mRNAに転写されない部分や、pre-mRNAに転写されても mRNAになる前に除去され消滅するイントロン部分の鋳型になる部分やmRNAに 一時的に転写されてもすぐに消滅する劣勢遺伝子由来のmRNAの鋳型になる部分 がある。 http://wc2014.5ch.net/test/read.cgi/life/1411392259/644
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