[過去ﾛｸﾞ] STAP細胞の懐疑点 PART680 (1001ﾚｽ)
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1(2): 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:55 AAS
疑問点・矛盾点を挙げつつ、建設的な議論を心がけていきましょう。
捏造・擁護煽り、レスの無駄遣いコピペ、中傷は厳禁。
次スレは「>>600」以降に立ててください
過去スレッド
STAP細胞の懐疑点 PART679 2chｽﾚ:life
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STAP細胞の懐疑点 PART677 2chｽﾚ:life
STAP細胞の懐疑点 PART676 2chｽﾚ:life
STAP細胞の懐疑点 PART675～PART1 2chｽﾚ:future
「STAP細胞の懐疑点」に関するテンプレ・スレッド2 2chｽﾚ:life
2(1): 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:56 AAS
【STAP作製できず、CDB 人員半減へ】
外部ﾘﾝｸ:www.nikkei.com
理研、ＳＴＡＰ作製できず 再生研の人員半減 2014/8/27 2:00 日本経済新聞 電子版
理化学研究所によるＳＴＡＰ細胞の検証実験で、これまで一度も同細胞を作製できなかったことが26日、分かった。
あらゆる臓器や組織になる万能性を示す十分なデータも得られておらず、実験は最初の段階で難航している。
ＳＴＡＰ細胞が存在する可能性は極めて低くなった。理研が27日に開く検証実験の中間報告に関する記者会見で表明する見通し。
理研は４月、１年間をメドにＳＴＡＰ研究の舞台になった発生・再生科学総合研究センター（神戸市、ＣＤＢ）で検証実験を開始、今夏に途中経過を中間報告するとしていた。
当初の計画では、ＳＴＡＰ細胞が存在するなら６月末までに作製できるとみていた。
その後、第２段階に移行し、作製した細胞を入れたマウスの胚から胎児を育てて観察、新しい万能細胞かどうかを判断する予定だった。
複数の関係者によると、弱酸性の溶液にマウスの細胞を浸すとＳＴＡＰ細胞ができるはずが、
省7
3: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:57 AAS
【STAP現象の検証の中間報告: STAP細胞再現できず】
外部ﾘﾝｸ[pdf]:www3.riken.jp より
一般的な実験マウスである C57BL/6 マウス由来の脾臓について論文に記載されてい
るプロトコールに従って検討を行ったが、論文に報告されたような STAP 細胞様細胞塊
の出現を認めることはできなかった。
外部ﾘﾝｸ[pdf]:www3.riken.jp より
C57BL/6マウス脾臓細胞から塩酸処理で得られた細胞集団の解析結果のまとめ
１．蛍光顕微鏡ならびにセルソーターを用いた解析で、GFPの蛍光を明確に検出することはできていない。
２．定量PCR法を用いた遺伝子発現解析で、内在性Oct3/4遺伝子の発現上昇は検出できていない。
３．細胞塊の免疫染色法を用いた解析で、内在性Oct3/4遺伝子の発現上昇は検出できていない。
4: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:57 AAS
【独立行政法人理化学研究所終了のお知らせ】
理研予算、概算要求で２割減額 独法化後初 文科省
外部ﾘﾝｸ:www.nikkei.com
日本経済新聞 2014/8/29 11:12
> 文部科学省は29日発表した2015年度予算の概算要求で、理化学研究所の要求額を14年度予算と比べて約１％減らした。
> 前年度の概算要求からは約２割の大幅減となる。独立行政法人に移行した03年度以降、初の減額要求。ＳＴＡＰ細胞の
> 研究不正問題が影響した形で、27日に公表した理研改革案の実行に注力するためだという。
>
> 国から理研に支出する運営費交付金として14年度予算より５億円少ない528億円を求めた。前年度の概算要求では648億円
> だった。文科省が所管する研究開発法人の中で減るのは理研だけ。通常は前年度より１～２割上乗せする例が多いが、
省18
5: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:58 AAS
【NHKスペシャル「調査報告 STAP細胞 不正の深層」まとめ (仮)】
外部ﾘﾝｸ[html]:www.nhk.or.jp
(このスレで指摘済みのものは除く)
・NHKは2000ページの内部資料を入手済み。小保方氏の実験ノートのコピーも入手
・STAP細胞から初めてキメラマウスの作成に成功したときの記述が小保方の実験ノートに存在しない (!) → 小保方氏に問合わせたが返答なし
・日本分子生物学会のメンバー (九大・中山教授、阪大・篠原教授、仲野教授ら) で論文を徹底検証。論文中の140の画像・グラフの7割に何らかの疑義・不自然な点があることを指摘
・若山研にあったES細胞が小保方氏の冷蔵庫から発見された。小保方氏側は「若山研から譲与された」としているが、そのES細胞の作製を行った当時の留学生は「渡していない」と話している。
省5
6: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:59 AAS
【日本学術会議幹事会声明「STAP細胞事案に関する理化学研究所への要望と日本学術会議の見解について」(2014年7月25日)】
外部ﾘﾝｸ[pdf]:www.scj.go.jp
以下内容の要約:
[STAP細胞事案の現状]
- STAP細胞事案は、研究全体が虚構であったのではないかという疑念を禁じ得ない段階に達している。
- 革新性を必要以上に強調した記者会見が開かれたことと、指摘された研究不正の深刻さから、我が国の科学研究全体に負のイメージを与えている。
[理研に対する要望]
- 「研究不正再発防止のための提言書」には、今回の事案の経過と原因、CDBの今後の在り方について詳細な考察が述べられている。野依理事長が明言したように、速やかに同提言書の内容を受けたアクションプランを策定し早急に実行に移せ
省5
7: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)18:59 AAS
【早稲田大学終了のお知らせ】
小保方氏の学位「取り消しに該当せず」 博士論文の早大調査委
外部ﾘﾝｸ:www.nikkei.com
理化学研究所の小保方晴子研究ユニットリーダーの博士論文に文章や画像の流用が疑われた問題で、
早稲田大の調査委員会は17日、調査結果を公表した。論文に26カ所の問題点があると指摘したが、誤っ
て草稿を提出していたと説明。「学位を取り消す規定には該当しない」と結論づけた。
外部ﾘﾝｸ[html]:www3.nhk.or.jp
外部ﾘﾝｸ[html]:megalodon.jp
これについて、日本分子生物学会の副理事長で、九州大学の中山敬一教授は「数百字ほどの盗用で
あっても、不正と認定されて責任を問われるのが科学界の常識で、２０ページにわたって文章をそのまま
省13
8: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:00 AAS
AA省
9: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:01 AAS
AA省
10: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:02 AAS
AA省
11: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:03 AAS
【STAP細胞 元細胞の由来，論文と矛盾】
日経サイエンス【号外】2014年6月11日
>
> 理化学研究所の小保方晴子ユニットリーダーが作ったSTAP細胞の一部が，
> 論文に記したような新生児マウスの細胞から作ったものではないことが，理研の
> 内部資料から明らかになった。
>
> 小保方氏らが論文とともに公開した遺伝子データを新たな手法で解析したところ，
> STAP細胞に含まれるほぼすべての細胞が，8番染色体が3本ある「トリソミー」であることが判明。
>
省19
12: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:03 AAS
[日経サイエンス8月号まとめ(仮)]
外部ﾘﾝｸ[html]:www.nikkei-science.com
8 番トリソミーや ES と TS の混ぜ混ぜ、若山氏の解析結果は既報のとおりなので省略すると、
重要な指摘は以下のとおり:
(STAP細胞のNGS解析について)
・NGS解析する細胞を取り違えた可能性は?
→ 解析は計4回 (SMARTer を 2 回、TruSeq を2回) 行われ、しかも1回ごとに新たなSTAP細胞を作ったとしており、
また SMARTer 同士、TruSeq 同士の解析結果は一致していることから、その可能性は考えにくい。
SMARTer の方には ES 細胞を使い、TruSeq の方には普通の体細胞を使ったと考えられる。
・SMARTer と TruSeq で細胞を使い分けた理由は?
省9
13: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:04 AAS
[日経サイエンス9月号まとめ (仮)]
外部ﾘﾝｸ:www.nikkei-science.com
(若山氏依頼の第三者機関の解析ミスの原因)
第三者機関が CAG-GFP の挿入しか想定しておらず、GFP のプライマーが実はアクロシンのプロモータであることに気付かなかった。
アクロシンとそのプロモーターはマウスにもともと存在する遺伝子で、場所は15番染色体。
このため FLS で GFP が 15 番染色体に挿入されているものと誤認した。
(解析ミス発覚の経緯)
6月12日(?) (研究不正再発防止のための改革委員会の最終日)
若山氏と kaho 氏が初めて顔を合わせる。kaho 氏、若山氏にプライマー情報の提供を打診
6月22日
省8
14: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:05 AAS
【STAP幹細胞の解析結果の7月22日時点でのまとめ】
外部ﾘﾝｸ[html]:mainichi.jp 外部ﾘﾝｸ[pdf]:www.riken.jp 外部ﾘﾝｸ[pdf]:jump.2ch.net
STAP幹細胞の由来について
1. FLS x 8株 (129B6F1-GFP マウス由来) [2012年1～2月]
→ 8株全て、CAG-GFP 遺伝子だけでなく、Acr-GFP遺伝子が同じ染色体部位に並んで挿入されている (挿入部位については解析中)
→ 8株全て、GFP遺伝子がヘテロ
つまり、若山氏が小保方氏に渡したマウスとは由来が異なる。
また、若山研で維持されていた129系統マウスと大阪大学岡部研由来のB6マウスを掛けあわせたマウス由来の可能性がある (CAG-GFP 遺伝子と Acr-GFP 遺伝子が共挿入されたB6マウスは岡部研で樹立された)
2. FLS-T x 2株 (129B6F1-GFP マウス由来。FLS の一年後に樹立) [2013年3月]
→ 矛盾なし
省18
15: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:05 AAS
AA省
16: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:06 AAS
[笹井氏、小保方氏から画像不正流用を伝えられ隠蔽工作ととられてもしかたのない行動をとる]
「ＳＴＡＰ」写真流用把握も問題と説明せず (NHK 2014年3月13日)
外部ﾘﾝｸ[html]:megalodon.jp
> ...
> ＮＨＫが関係者に取材したところ、およそ１か月前には、小保方さんと、研究チームの中心メンバーで
> 研究所の副センター長がこの問題を把握していたことが分かりました。
> さらに外部の有識者も入った調査委員会のメンバーには、この問題が単なる画像の取り違いと伝えられ、
> 流用の疑いもある重要な問題だとは説明されていなかったということです。
>
> これについてこの副センター長は広報を通じ、「調査に関わることなので話せない」とするコメントを出しました。
省14
17: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:07 AAS
【STAP問題における笹井芳樹氏の時系列: 2012年12月～2013年04月】
[2012年12月21日] 小保方氏の採用面接に参加
[2012年12月28日] 笹井版 Article 論文の叩き台作成 (8月にScienceに却下された論文を小保方氏が12月に改訂した物)
[2012年12月??日～] 小保方氏と共に Letter 論文の執筆開始 (小保方氏が若山研時代に得たデータを基に執筆) STAP細胞の胎盤への寄与等が初めて記載される?
[2013年01月??日] 丹羽氏の質問によりSTAP-SCでTCR再構成が無いことが判明。なお笹井氏はこれ以前に何故かその事実を把握済み。
[2013年01～03月] 笹井研で小保方氏が撮影したライブイメージング画像を確認。また、小保方氏作製のSTAP細胞の in vitro での分化実験を笹井研室員が確認
[2013年03月01日] 小保方氏が CDB にユニットリーダーとして着任。以降、小保方ラボの立ち上げまで笹井研に間借り
[2013年03月10日] 笹井版 Nature 論文二編を投稿 (以降採録まで改訂・追加実験を繰返す)
[2013年04月24日] 発明者の一人として国際特許出願を行う。
それまでに出願済みの2本の米国仮特許出願との相違点は
省3
18: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:08 AAS
【STAP問題における笹井芳樹氏の時系列: 2013年5月～2014年8月】
[2013年05～09月?] 小保方氏が次世代シーケンサーによる解析を行う
この解析データについては kaho 氏や複数の大学の研究チームによって疑義・不正が指摘されている。
[2013年08月??日] 若山氏から「責任著者から外して欲しい」との申し出を受けたがこれを慰留
[2013年10月??日] 小保方ラボ工事完了・立ち上げ
[2013年12月20日] 笹井版 Nature 論文二編の採録決定。上述の国際特許出願との相違点は
1. 光る胎児と胎盤の画像
2. メスのSTAP-SC
3. 実験条件の異なる博士論文からの画像の不正流用、等
光る胎児と胎盤の画像については、不可解な画像の誤用、また画像修正等の不正の可能性も指摘されている。
省9
19: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:09 AAS
[STAP細胞から作ったキメラマウスのTCR構成に関する疑惑]
2chｽﾚ:life
759 ：名無しゲノムのクローンさん：2014/08/12(火) 00:51:59.26
NHK スペシャルで
> ・論文には「STAP細胞から作ったキメラマウスのTCR再構成を調べた」とはあるが「再構成があった」とは書かれていない。
みたいな突っ込みが入っていたわけだけど、
米国仮特許出願 US 61/779,533 と国際特許出願 PCT/US2013/037996 には
ずばり「STAP細胞由来の2NキメラマウスにTCR再構成が見られた」っていう実験の記載がある
省20
20: 名無しゲノムのクロ� [ンさん[sage] 2014/08/31(日)19:10 AAS
【STAP細胞の胎盤寄与・STAP幹細胞・FI幹細胞の時系列】
2011年11月頃
小保方氏・若山氏、STAP細胞の樹立、キメラマウスの作製に成功
若山氏、STAP幹細胞 (STAP細胞の培養手法?) の樹立に成功
2012年4月24日
米国仮特許出願 (US61/637,631)、STAP細胞の胎盤寄与、STAP/FI幹細胞に関する記述なし (ただし、STAP細胞の培養に関する言及あり?)
2012年06月頃
[自己点検報告書によれば]
小保方氏、STAP細胞から胎盤形成に寄与する幹細胞 (FI-SCか?) を樹立する研究に取り組む
(ただし、実際にいつ樹立に成功したかは不明。
省18
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