[過去ログ] STAP細胞の懐疑点 PART706 (1001レス)
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77
(4): 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I 2014/09/23(火)22:54 AAS
>>69
遠藤高帆の言わんとする意味はわかるが、「SNPs in mRNAs」という表記が
間違ってると述べてるのだ。

>小保方が登録したRNA-seqデータからstrain specificなSNPs抽出して解析してるんだよ。

極めて細かい事だが、イントロン部分はpre-mRNAに転写されるが除去されて
mRNAになると消滅する。よほど感度が高くなければpre-mRNAは検出できない
はずだ。
そして一つの遺伝子に複数のイントロン部分のSNPが存在する事もある。
その場合、mRNAの差異から対応するSNPが特定できない場合も例外的にある。
87
(1): 2014/09/23(火)23:08 AAS
>>77
pre mRNAなんか読んでねーしw
matureなmRNAにだってstrain specificなSNPs探せるだろ?
そんなことも分からないのか?小卒w
94
(1): 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I 2014/09/23(火)23:11 AAS
>>87
だから>>77で、下記のように書いてる。

>遠藤高帆の言わんとする意味はわかるが、「SNPs in mRNAs」という表記が
>間違ってると述べてるのだ。
184
(2): 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I 2014/09/24(水)01:24 AAS
>>77の訂正

(誤)極めて細かい事だが、イントロン部分はpre-mRNAに転写されるが除去されて
mRNAになると消滅する。よほど感度が高くなければpre-mRNAは検出できない
はずだ。
そして一つの遺伝子に複数のイントロン部分のSNPが存在する事もある。
その場合、mRNAの差異から対応するSNPが特定できない場合も例外的にある。

(正)極めて細かい事だが、もし仮に、優性遺伝子を生化学的に不活性化して
劣性に変えるSNPが単一の優性遺伝子に複数個存在すれば、劣性遺伝子による
ナンセンスmRNAが速やかに分解されるので、正常なmRNAが不存在だとしても
劣性遺伝を引き起こす複数のSNPのいずれが原因か不明だ。
省1
192: 浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I 2014/09/24(水)01:28 AAS
>>115
>exon中にmapされるSNPsについてはmRNA見れば分かるだろ?w

たしかに、その通りでした。>>77の例が不適切なので、>>184で訂正しました。
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